Título: Ensamblaje y mapeo de secuencias NGS utilizando Galaxy. Manejo de archivos SAM y BAM.
Autor: Cardona Serrate, Fernando
Resumen: En este artículo se describe paso a paso cómo analizar los datos de secuenciación de segunda generación, en concreto, cómo analizar los archivos de secuencia mapeados con el genoma de referencia (SAM o BAM) que obtenemos en secuenciación de nueva generación (NGS, de Next Generation Sequencing). Además, se estudia cómo se pueden visualizar y analizar su calidad, principalmente analizando la cobertura y la profundidad de lectura. Todo ello podemos hacerlo utilizando la herramienta Galaxy y sin necesidad de conocimientos bioinformáticos avanzados.
